Martina Bremer
Professor
统计,生物统计学
408-924-1396
martina.bremer@yihetianquan.com
MH 318A
Research Areas
- Statistics
- Bioinformatics
Biography
我是一名统计学家,对生物信息学感兴趣. 我特别感兴趣 在分析和解释微阵列数据. DNA微阵列(或基因芯片) 存在于许多生物体-动物,植物和人类. 它们被用来测量 许多基因(人类大约有3万个蛋白质编码基因)被“翻转”的程度 在任何给定的时间. 研究人员对测量基因表达感兴趣 研究哪些基因与特定的疾病(如癌症)有关.
基因受到许多因素的影响:生物体所受的外部因素 to (e.g.如干旱对植物或疾病对人类),但基因和蛋白质也有影响 彼此在一个复杂的网络中. 是否有可能识别出出现问题的基因 或者被其他基因或蛋白质下调在微阵列数据中? This 本文利用状态空间模型对基因调控进行了研究 thesis [pdf].
Publications
- 哈什·巴蒂亚,阿提拉·G. 古拉西,瓦莱里奥·帕斯库奇,玛蒂娜·布雷默,米切尔·T. Ong, 文森佐·洛尔迪,埃里克·W·. Draeger, John E. 帕斯克和同行蒂莫·布雷默. 通过相对角度分布的原子轨迹的交互探索 及有关的不确定因素[pdf]. 第9届IEEE太平洋可视化研讨会论文集,pp. 120–127, Taipei, Taiwan. Apr. 19–22, 2016.
- M. Bremer, R.W. Doerge, 在工作台使用R -生物学家一步一步的数据分析, 冷泉港出版社,2015.
- T. Nguyen, D. Ravindra, B. Kwong, S. Waheed, N. Tarlton, R. Ferguson, M. Bremer, T. Abramson, 波氏菌效应记忆细胞α - 4整合素的差异表达 infections. B中的延迟反应. pertussis. PLOS One, 2012年12月,第7卷,第12期.
- S. Yadegarnynia, A. Pham, A. Ng, D. Nguyen, T. Lialiutska, A. Bortolazzo, V. Syvriuk, M. Bremer, J.B. White, 类黄酮在人乳腺癌细胞系中的细胞毒性分析:测定 结构-功能关系. 天然产品通讯,7 (10),2012.
- N.J. Tarlton, C.M. Green, N.H. Lazarus, L. Rott, A.P. Wong, O.N. Abramson, M. Bremer, E.C. Butcher, T. Abramson, 质母细胞频率和运输受体表达在儿科发生改变 ulcerative colitis. 炎症性肠病, April 5, 2012.
- J. Park, P.L. Knezevich, W. Wung, S.N. O’Hanlon, A. Goyal, K.L. Benedetti, B.J. Barsi-Rhyne, M. Raman, N. Mock, M. Bremer, M.K. VanHoeven, 隐杆线虫炎中保守的近肽信号调节突触伴侣识别 elegans,神经发育,6:28,2011.
- A.Madlung, M. Bremer, E. Himelblau, A. Tullis, 一项评估跨学科数学-生物学潜在负面影响的研究 Education, CBE -生命科学教育,卷10,43 - 54,2011年春季.
- M. Bremer & R.W. Doerge, 板凳上的统计学:生物学家一步一步的手册,冷泉港出版社,2010
- M. Bremer, E. Himelblau, A. Madlung, 双色微阵列数据统计分析导论 (书中的一章)Bang, H, Zhou, XK, Van Epps, H, Mazumdar, M. (编辑)统计 分子生物学方法. Humana Press. 2010.
- M. Bremer & R.W. Doerge, km -算法在时间序列表达数据中识别调控基因,生物信息学进展,2009